延喜式内大社で、旧県社、大神神社（オオミワジンジャ）の別宮。
日本書記によると、主神 三穂津姫命（ミホツヒメ）は、高皇産霊命（タカミムスビノミコト）の姫神で大物主命（オオモノヌシノミコト）が国譲りをされたときその功に報いるためと大物主命の二心のないようにという願いから、自分の娘を贈られたという神話に出てくる神である。
この故事から縁結びの神、家内安全の神として信仰され、大物主命は大神神社の祭神で、その妃神を祭っていることから、大神神社の別宮とも称せられている。
かつて、この地では正月の大とんどで大神神社と村屋神社の火種子をもらって帰り、みよと（夫婦）火とし、それで雑煮を炊いて1年の家内安全を家族で祈願していたという習慣が残っていた。

「延喜式」神名帳 式下郡に村屋坐弥冨都比賣神社・村屋神社・久須須美神社・服部神社が記載されており、天武天皇元年（６７３）壬申の乱のとき村屋神が神主にのりうつって「わが杜の中を敵が来る。社の中つ道を防げ」と大海人皇子方の大伴連吹負将軍に軍備に対する助言をした。この功績によって神社として初めて位を天皇から賜ったと日本書紀に記されている。
その後も何度か位を賜り現在正一位森屋大明神の呼称が残っている。
壬申の乱の功を後世に伝えるためにこのとき功のあった三神を回る御渡が例祭に行われていた。三神とは村屋神を祭る村屋神社、事代主命を祀る久須須美神社、生雷神を祀る森市神社である。

天正の頃（１５８０年頃）戦火に遇い社地を奪われ財源がなくなり、一時祭祀は中絶していたが、慶長4年（1599年）52代神主大神（森本）政重によって、現在の規模に縮小して再興を果たしたとされている。

村屋神社（むらやじんじゃ）

祭神：「天津屋根命、経津主神、比咲大神、武甕槌神、大伴健持大連、室屋大連」
本社東の川辺、字宮ノ山に鎮座していたが天正年間、現在の地に移された。

服部神社（はっとりじんじゃ）

祭神：「天之御中主命、天之御鉾命」
大字大安寺カキノモリに鎮座していたが、南北朝時代に戦火に遭い、
現在地に移される。

市杵嶋姫神社（いちきしまひめ）・物部神社（もののべ）

祭神：「炊屋姫命、宇麻志摩遲命　配　物部守屋連」
由緒不祥、神主の祖神を祀ったといわれている。

久須須美神社（恵比須神社）（くすすみじんじゃ）

祭神：「天之久久之遅命、事代主命」
本社東の川辺、恵比須山に鎮座していたが、明治初年に現在地に移される。
大字伊与戸の氏神であった。